Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U1

MS4A15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A15Q8N5U1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MS4A15Q8N5U1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MS4A15Q8N5U1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MS4A15Q8N5U1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MS4A15Q8N5U1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MS4A15Q8N5U1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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MS4A15Q8N5U1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MS4A15Q8N5U1 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A15Q8N5U1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A15Q8N5U1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A15Q8N5U1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A15Q8N5U1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A15Q8N5U1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MS4A15Q8N5U1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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