Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCBE1Q6UXH8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCBE1Q6UXH8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms