Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 MX2-213ENST00000496774 827 ntTSL 313.71□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SPATA7-207ENST00000553908 761 ntTSL 513.58□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 BAD-204ENST00000492141 359 ntTSL 513.5□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TNK2-211ENST00000438207 870 ntTSL 513.48□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R2-205ENST00000462906 1668 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR41-206ENST00000506307 582 ntTSL 313.4□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 IGF2BP3-203ENST00000465058 534 ntTSL 413.35□□□□□ -0.278e-14■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR41-217ENST00000511036 805 ntTSL 513.3□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ALOX12P2-204ENST00000571201 480 ntTSL 513.27□□□□□ -0.284e-20■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SPATA7-222ENST00000557724 568 ntTSL 413.27□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-211ENST00000507210 582 ntTSL 313.22□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AFAP1-205ENST00000505447 1517 ntTSL 213.2□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OXR1-204ENST00000438229 1436 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ALKBH3-212ENST00000534171 764 ntTSL 513.11□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 MRPL39-203ENST00000419219 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.09□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SPATA7-206ENST00000553885 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.07□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 MAGOHB-205ENST00000540074 705 ntTSL 513.06□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SPATA7-213ENST00000555515 1088 ntTSL 313.06□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ABHD10-202ENST00000491580 1339 ntTSL 213.06□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 XRRA1-205ENST00000525407 986 ntTSL 513.01□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 MSH5-208ENST00000429846 616 ntTSL 312.98□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.347e-8■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 NCAPH2-206ENST00000518394 720 ntTSL 512.95□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SPATA7-221ENST00000557567 457 ntTSL 312.87□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ABHD10-203ENST00000493784 890 ntTSL 312.81□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 STAU2-204ENST00000518767 1146 ntTSL 1 (best)12.8□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 DUS4L-205ENST00000443233 1676 ntTSL 212.78□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 XRRA1-217ENST00000533598 872 ntTSL 312.76□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.389e-8■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 BAD-205ENST00000493798 325 ntTSL 212.69□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 LRR1-203ENST00000540712 1597 ntTSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.388e-14■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TACC2-218ENST00000492237 438 ntTSL 512.65□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 NPHP4-205ENST00000466897 1192 ntTSL 1 (best)12.62□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 XRRA1-204ENST00000524430 561 ntTSL 412.57□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ITGA10-202ENST00000468261 1438 ntTSL 212.34□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AFAP1-207ENST00000513842 1638 ntTSL 212.32□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 FAM213B-209ENST00000476686 2506 ntTSL 1 (best)12.24□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 DUS4L-204ENST00000436411 2280 ntTSL 212□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ALKBH3-207ENST00000530803 1557 ntTSL 211.97□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ARHGEF2-215ENST00000487755 2176 ntTSL 211.97□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SPATA7-215ENST00000555715 545 ntTSL 411.88□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR13-207ENST00000482760 562 ntTSL 311.81□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 NCAPH2-204ENST00000418794 640 ntTSL 511.8□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 DUS4L-211ENST00000498786 491 ntTSL 311.73□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 RABGAP1L-209ENST00000457696 1847 ntTSL 1 (best)11.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SPATA7-208ENST00000554102 501 ntTSL 311.63□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TACC2-220ENST00000493951 645 ntTSL 511.6□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 RPAP1-208ENST00000565167 1712 ntTSL 1 (best)11.5□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-220ENST00000509963 432 ntTSL 211.48□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ADD3-213ENST00000487085 708 ntTSL 311.42□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ADD3-211ENST00000484622 401 ntTSL 511.42□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 GARNL3-206ENST00000439286 905 ntTSL 511.4□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 LRWD1-205ENST00000473880 5491 ntTSL 211.39□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TMEM67-209ENST00000474944 1986 ntTSL 1 (best)11.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-215ENST00000508996 348 ntTSL 411.37□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 UCHL3-203ENST00000471792 696 ntTSL 311.36□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TOR3A-204ENST00000447595 730 ntTSL 211.32□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 COPB1-209ENST00000533096 547 ntTSL 411.3□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 OCIAD1-219ENST00000509664 538 ntTSL 511.21□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ZNF44-205ENST00000397742 2372 ntTSL 211.2□□□□□ -0.622e-9■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 AP3M2-210ENST00000521235 189 ntTSL 411.18□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 27.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR41-210ENST00000507452 680 ntTSL 311.07□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 27.8
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1859.4 ms