Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BROXQ5VW32 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms