Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC7Q5VTL7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC7Q5VTL7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC7Q5VTL7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FNDC7Q5VTL7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FNDC7Q5VTL7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms