Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM164Q5U3C3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM164Q5U3C3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms