Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FGD3Q5JSP0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGD3Q5JSP0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGD3Q5JSP0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGD3Q5JSP0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGD3Q5JSP0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FGD3Q5JSP0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms