Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT3Q5FWE3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRRT3Q5FWE3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms