Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIPR1Q53HC9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms