Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC36A3Q495N2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms