Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TWISTNBQ3B726 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TWISTNBQ3B726 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms