Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LETM2Q2VYF4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms