Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CCDC96Q2M329 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC96Q2M329 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms