Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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GEN1Q17RS7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GEN1Q17RS7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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