Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP6Q16828 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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