Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FSCN1Q16658 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms