Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK3Q16288 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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