Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHRNA2Q15822 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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