Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TWIST1Q15672 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms