Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRADDQ15628 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRADDQ15628 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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