Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CDSNQ15517 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
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