Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKIV2LQ15477 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms