Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBE3CQ15386 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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