Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms