Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
R3HDM1Q15032 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
R3HDM1Q15032 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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