Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NCAPHQ15003 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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