Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHPRHQ149N8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SHPRHQ149N8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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