Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM25Q14258 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms