Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CKAP5Q14008 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms