Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBFBQ13951 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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