Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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CAPSQ13938 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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CAPSQ13938 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAPSQ13938 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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