Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NCOA4Q13772 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NCOA4Q13772 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NCOA4Q13772 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NCOA4Q13772 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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