Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTCH1Q13635 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTCH1Q13635 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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