Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
IRF5Q13568 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRF5Q13568 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms