Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB3Q13509 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms