Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LSAMPQ13449 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LSAMPQ13449 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LSAMPQ13449 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LSAMPQ13449 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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