Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCOF1Q13428 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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