Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CLN3Q13286 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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