Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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