Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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PTPRJQ12913 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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