Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SREBF2Q12772 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SREBF2Q12772 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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