Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SCAPQ12770 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCAPQ12770 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms