Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC15Q0P6D6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms