Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM3Q08188 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms