Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PAX8Q06710 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms