Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LTBQ06643 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LTBQ06643 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LTBQ06643 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LTBQ06643 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms