Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IRF8Q02556 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms