Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HSF1Q00613 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HSF1Q00613 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms