Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EEF1A1P68104 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EEF1A1P68104 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms