Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS3AP61247 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms